More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1219 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  100 
 
 		 360 aa  698    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  81.59 
 
 		 355 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  70.54 
 
 		 356 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  69.97 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  64.39 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  57.96 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  51.16 
 
 		 347 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  50.74 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  50.59 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  52.82 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  49.12 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  50.98 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  52.21 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  52.21 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  51.92 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  52.21 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  51.92 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  53.12 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  47.9 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  43.99 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  50.89 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  48.24 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  50.89 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  50.89 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  50.72 
 
 		 360 aa  295  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  49.3 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  50.45 
 
 		 352 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  45.72 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  51.29 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.09 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  48.6 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  51.92 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  42 
 
 		 362 aa  268  8e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  45.74 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  46.22 
 
 		 352 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  45.93 
 
 		 352 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  45.11 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  52.41 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  47.08 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.86 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  42.21 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  38.33 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  37.36 
 
 		 355 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  46.61 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  40.25 
 
 		 374 aa  225  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  41.98 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  40 
 
 		 359 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  40 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  42.27 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  35.16 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  38.51 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  36.36 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  36.44 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  36.09 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.68 
 
 		 383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  35.57 
 
 		 344 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  40.13 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  41.72 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  39.2 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  38.46 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.6 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  33.53 
 
 		 348 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  39.93 
 
 		 301 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  35.24 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  38.31 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  34.31 
 
 		 348 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  34.27 
 
 		 358 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  40.52 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.68 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  37.83 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  34.15 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 356 aa  192  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  32.95 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.7 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  37.46 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  38.61 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  34.81 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  38.07 
 
 		 356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  37.18 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  39.4 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  39.7 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  36.02 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  32.16 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.27 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  37.46 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  36.45 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.33 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  36.56 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  35.56 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36.79 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  35.76 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  35.56 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  37.11 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  37.27 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>