More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0834 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  98.61 
 
 		 359 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  98.61 
 
 		 359 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  100 
 
 		 359 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  99.16 
 
 		 359 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  98.61 
 
 		 359 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  68.42 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  73.99 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  72.6 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  73.43 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  72.51 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  72.51 
 
 		 353 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  73.62 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  72.51 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  70.95 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  64.18 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  63.67 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  57.23 
 
 		 352 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  55.15 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  51.41 
 
 		 365 aa  336  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  52.66 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  51.34 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  50.6 
 
 		 355 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  52.21 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  51.81 
 
 		 356 aa  316  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.4 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  50.57 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  48.86 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  54.33 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  58.92 
 
 		 353 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  43.86 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  42.69 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  44.37 
 
 		 331 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  53.25 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  43.03 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  44.08 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  40.06 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  44.86 
 
 		 367 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.7 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  44.85 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.57 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  41.16 
 
 		 350 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  41.79 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  41.49 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  39.09 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.35 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  35.36 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  37.94 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  38.92 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  39.67 
 
 		 374 aa  212  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  40.34 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  36.18 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  38.06 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  41.05 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  41.11 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  36.87 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  44.41 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  36.07 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  36.36 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  40.68 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  36.15 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  34.88 
 
 		 349 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  41.99 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.85 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  32.56 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.96 
 
 		 348 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  34.25 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.46 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  35.55 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  35.26 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  36.87 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  32.66 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  36.69 
 
 		 361 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  37.19 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.35 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  30.58 
 
 		 359 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  34.62 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.65 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.27 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  38.15 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.78 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.61 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  35.09 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  33.15 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.34 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  39.64 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  34.36 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  36.93 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  36.93 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  36.93 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  36.56 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  38.01 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  34.1 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  36.93 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  35.24 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.65 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>