More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3222 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  100 
 
 		 360 aa  694    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  89.44 
 
 		 360 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  89.44 
 
 		 360 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  89.8 
 
 		 353 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  83.06 
 
 		 360 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  84.12 
 
 		 360 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  83.61 
 
 		 360 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  78.06 
 
 		 357 aa  521  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  83.06 
 
 		 360 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  74 
 
 		 359 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  73.43 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  73.43 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  74.85 
 
 		 359 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  75.15 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  65.88 
 
 		 371 aa  428  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  66.99 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  55.62 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  60.38 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  54.76 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  54.01 
 
 		 356 aa  335  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  51.78 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  51.78 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  50 
 
 		 347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  52.51 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  49.3 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  57.61 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  49.58 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  59.11 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  50.81 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.7 
 
 		 347 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  46.02 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  46.23 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  44.12 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  41.43 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  52.11 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  46.25 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  47.33 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.6 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  42.49 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  45.21 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  44.93 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.41 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  39.3 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  41.11 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  41.11 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  40.23 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  35.97 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  32.96 
 
 		 360 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  41.82 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  37.9 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  38.41 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  41.51 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  40.07 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  37.93 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  38.46 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  43.16 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  36.28 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  33.33 
 
 		 348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  34.17 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  35.73 
 
 		 375 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  34.41 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  37.54 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  35.89 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.19 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  33.91 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  39.06 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  34.72 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.56 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.02 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  38.39 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  37.22 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  32.55 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.62 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.77 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  37.63 
 
 		 361 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.28 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.28 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  36.51 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.97 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  38.98 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  41.26 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  38.14 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  38.14 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  38.14 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  36.16 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.15 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  31.97 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.53 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  38.6 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.91 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.5 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  38.11 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  36.92 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38.91 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.36 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  35.9 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  36.26 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  41.03 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>