More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1539 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  100 
 
 		 360 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  100 
 
 		 360 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  100 
 
 		 353 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  89.8 
 
 		 360 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  75.92 
 
 		 357 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  84.55 
 
 		 360 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  84.84 
 
 		 360 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  84.15 
 
 		 360 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  84.26 
 
 		 360 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  72.81 
 
 		 359 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  73.1 
 
 		 359 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  72.51 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  73.1 
 
 		 359 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  72.51 
 
 		 359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  62.54 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  65.38 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  53.25 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  60.38 
 
 		 352 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  52.96 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  53.87 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  55.29 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  53.19 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  51.62 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  48.84 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  50.89 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  57.42 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  50.15 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  58.76 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  47.49 
 
 		 354 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.4 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  45.7 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  43.53 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  45.43 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  53.42 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  47.69 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  44.71 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  41.76 
 
 		 350 aa  245  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.65 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  44.61 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  41.85 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.94 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.83 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  38.64 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  40.29 
 
 		 352 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  40.29 
 
 		 352 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  38.95 
 
 		 357 aa  216  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  36.75 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  44.93 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  33.61 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  41.82 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  38.98 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  33.43 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  33.33 
 
 		 348 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  34.22 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  43.45 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  40.57 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  36.93 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  37.32 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  33.43 
 
 		 344 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.47 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.47 
 
 		 348 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  36.98 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  37.54 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  38.72 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  30.81 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  35.19 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.66 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  37.77 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  35.56 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  34.83 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  36.45 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  36.25 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  37.14 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  39.66 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.79 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  38.06 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  37.63 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  36.58 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  37.82 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  37.82 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  37.82 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.19 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.08 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.08 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40.27 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  35.69 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.64 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  36.22 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.44 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.63 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.15 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  35.85 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0534  transport system permease protein  34.64 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.08 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  35.03 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  35.53 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  37.02 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  37.54 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>