More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0282 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  100 
 
 
371 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  62.54 
 
 
357 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  65.23 
 
 
360 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  63.29 
 
 
360 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  65.88 
 
 
360 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  66.67 
 
 
360 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  62.72 
 
 
360 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  63.88 
 
 
359 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  61.2 
 
 
359 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  64.18 
 
 
359 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  64.18 
 
 
359 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  60.93 
 
 
359 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  62.54 
 
 
353 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  62.54 
 
 
360 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  62.54 
 
 
360 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  67.52 
 
 
360 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  55 
 
 
352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  53.78 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  51.78 
 
 
356 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  52.42 
 
 
365 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  52.07 
 
 
356 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  49.86 
 
 
355 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  50.59 
 
 
360 aa  315  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  51.23 
 
 
356 aa  308  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  50.44 
 
 
360 aa  308  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  48.3 
 
 
354 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  54.93 
 
 
344 aa  296  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  44.67 
 
 
347 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  60.41 
 
 
353 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 
352 aa  276  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  42.52 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  45.54 
 
 
331 aa  272  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  42.82 
 
 
347 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  53.85 
 
 
343 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  44.54 
 
 
354 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  45.42 
 
 
319 aa  237  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  41.88 
 
 
350 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.83 
 
 
355 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  43.4 
 
 
350 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  40.74 
 
 
352 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  41.21 
 
 
352 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
373 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  40.07 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  33.62 
 
 
360 aa  212  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  36.54 
 
 
383 aa  210  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  35.16 
 
 
354 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  38.14 
 
 
374 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  35.61 
 
 
357 aa  205  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  43.57 
 
 
301 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  37.24 
 
 
363 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  38.29 
 
 
369 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  32.37 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  36.5 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  38.92 
 
 
362 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  35.68 
 
 
375 aa  200  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  35.29 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  35.11 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  34.78 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.69 
 
 
347 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  36.96 
 
 
356 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  34.87 
 
 
357 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  34.02 
 
 
344 aa  193  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  33.92 
 
 
344 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.16 
 
 
348 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  33.62 
 
 
361 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.48 
 
 
348 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.72 
 
 
336 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.1 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  32.55 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  33.91 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  34.56 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  36.39 
 
 
341 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  37.57 
 
 
356 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  35.34 
 
 
363 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  39.86 
 
 
357 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  31.34 
 
 
357 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  37.28 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  38.81 
 
 
350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  35.46 
 
 
347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  37.34 
 
 
354 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.54 
 
 
346 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  39.45 
 
 
340 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  36.71 
 
 
338 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  37.42 
 
 
336 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  34.25 
 
 
366 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  35.84 
 
 
368 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.73 
 
 
337 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36 
 
 
343 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  34.06 
 
 
371 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  33.72 
 
 
356 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.13 
 
 
372 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  32.24 
 
 
359 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  33.95 
 
 
319 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.36 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  35 
 
 
343 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.03 
 
 
338 aa  165  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  33.64 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>