More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0647 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 344 aa  682    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  45.68 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  46.79 
 
 		 340 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  45.23 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  45.08 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  44.97 
 
 		 322 aa  261  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  43.75 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  43.56 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  42.11 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  41.59 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  37.46 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  42.17 
 
 		 346 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  43.2 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  39.15 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  34.29 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  42.33 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  33.76 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  33.92 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.82 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  32.02 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  37.24 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  34.57 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  35.28 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  32.28 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  33.23 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  31.86 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  33 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  33 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  33 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  33 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  32.09 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  31.78 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  31.23 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  30.79 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  28.25 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  29.97 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  33.14 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  30.98 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  28.65 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  31.37 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  30.22 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  28.99 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  33.12 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  30.18 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  30.56 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  32.47 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  29.5 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  31.65 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  30.77 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  30.38 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  30.86 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  32.37 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  31.02 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  33.02 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  30.27 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  29.97 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  29.29 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  32.81 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  29.71 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  30.43 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  28.66 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  28.99 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  29.41 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  29.53 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  31.01 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  29.97 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  31.69 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  32.99 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  30.75 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  31.86 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  30.53 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  29.88 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  31.86 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  29.26 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  29.88 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  31.7 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  29.88 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  32.13 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  30.45 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  29.91 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  30.28 
 
 		 452 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  32.19 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  28.32 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  29.59 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  32.65 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  31.82 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  31.82 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  30.91 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  29.64 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 		 325 aa  140  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  34.44 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  30.56 
 
 		 347 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  31.79 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  30.06 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  33.44 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  28.92 
 
 		 373 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>