More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1298 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  100 
 
 		 362 aa  705    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  81.2 
 
 		 364 aa  528  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  59.94 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  53.54 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  49.85 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  50.31 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  49.04 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  47.53 
 
 		 322 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  48.33 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  44.81 
 
 		 344 aa  262  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  46.89 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  45.77 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  40.48 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  47.08 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  38.05 
 
 		 348 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  45.03 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  35.96 
 
 		 343 aa  199  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.49 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  32.83 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  33.86 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  41.08 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  32.87 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  33.77 
 
 		 357 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1791  vtamin B12-transporter permease  37.33 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.979653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1920  vtamin B12-transporter permease  37.33 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1915  vtamin B12-transporter permease  37.33 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  35.31 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  36.21 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  36.21 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  36.21 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  36.21 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  36.21 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01680  vtamin B12-transporter permease  37.37 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1931  transport system permease protein  37.37 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00205827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1479  vtamin B12-transporter permease  37.37 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.950653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01669  hypothetical protein  37.37 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.028051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  32.13 
 
 		 370 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1930  vtamin B12-transporter permease  37.02 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  35.31 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2429  vtamin B12-transporter permease  37.37 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  31.04 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  33.11 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  31.35 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  31.35 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  31.35 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  33.45 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  33.45 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  29.43 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  31.04 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  32.75 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  33.69 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  31.32 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  34.07 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  28.8 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  32.37 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  34.56 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  29.94 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  31.78 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  30.19 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  30.79 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  29.65 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  33.11 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  29.71 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  30.99 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  33.02 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  31.97 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  30.42 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  29.6 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  32.64 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  29.39 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  30.39 
 
 		 368 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30.54 
 
 		 337 aa  143  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  30.12 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  31.44 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  34.49 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  33 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  33.22 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  34.42 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  30.12 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  31.21 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  33.44 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  30.77 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  30.87 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  31.35 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  33.33 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  31.75 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  33.45 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  32.42 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  30.98 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  35.64 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  36.18 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  32.84 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  26.4 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  31.4 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  30.09 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  30.25 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  30.55 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>