More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3497 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  100 
 
 		 355 aa  658    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  70.11 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  61.67 
 
 		 364 aa  328  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  56.43 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  48.45 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  51.71 
 
 		 371 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  45.43 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  43.6 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  45.03 
 
 		 356 aa  252  9.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  47 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  42.95 
 
 		 340 aa  249  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  41.64 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  43.67 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  44.55 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  43.54 
 
 		 344 aa  235  9e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  52.17 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  40.74 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.05 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  33.63 
 
 		 343 aa  185  9e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  42.6 
 
 		 334 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  35.78 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  33.33 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  34.28 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  34.65 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  39.15 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  34.71 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  37.58 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.12 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  36.34 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.49 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  38.07 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  34.23 
 
 		 371 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  36.66 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  36.15 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  36.05 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  35.33 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  35.76 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  31.12 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  29.72 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  36.07 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  36.49 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  29.38 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.21 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  33.14 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  34.68 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  37.14 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  35.03 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  30.31 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  37.84 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  33.14 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  35.08 
 
 		 346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  35.4 
 
 		 354 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  33.53 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  34.11 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  37.42 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  36.83 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  28.37 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  35.76 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  33.45 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  33.14 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  34.25 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  35 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  34.83 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  36.09 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  34.23 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  35.47 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  31.67 
 
 		 331 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  33.24 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  35.47 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  29.61 
 
 		 359 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  35.47 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  35.47 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  35.47 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  35.15 
 
 		 345 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  38.08 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  35.05 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  33.82 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  35.71 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  39.32 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  34.81 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  36 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  31.27 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1389  iron (III) ABC transporter, permease  31.66 
 
 		 332 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.953687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  32.72 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  38.24 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0113  transport system permease protein  33.73 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  38.18 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  33.03 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  33.13 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  32.03 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  31.66 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  35.78 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  32.96 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  35.45 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  38.14 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  29.34 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>