More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0114 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  100 
 
 
349 aa  687    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  53.87 
 
 
348 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  35.47 
 
 
340 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
344 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  36.14 
 
 
322 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  31.53 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  35.29 
 
 
348 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  33.13 
 
 
359 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  33.13 
 
 
362 aa  176  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  35.92 
 
 
343 aa  175  9e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  32.76 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  35.1 
 
 
340 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.95 
 
 
330 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  32.07 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  32.82 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  31.53 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  35.26 
 
 
356 aa  162  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  31.79 
 
 
355 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  33.94 
 
 
336 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  33.84 
 
 
371 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  31.69 
 
 
331 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  31.29 
 
 
330 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  32.76 
 
 
371 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  35.43 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  33.23 
 
 
327 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  34.3 
 
 
328 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  33.53 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  31.74 
 
 
370 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  31.2 
 
 
348 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  31.21 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  31.37 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  31.07 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  30.99 
 
 
367 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.44 
 
 
337 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  30 
 
 
356 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  31.99 
 
 
334 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  31.62 
 
 
373 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  30.23 
 
 
328 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 
328 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  30.23 
 
 
328 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  32.93 
 
 
374 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  29.86 
 
 
355 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  30.52 
 
 
362 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  33.79 
 
 
367 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  30.12 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  33.01 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.55 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  30.54 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  30.31 
 
 
338 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  32.04 
 
 
358 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  30.7 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  33.52 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  31.1 
 
 
362 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  28.19 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  31.65 
 
 
350 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  29.02 
 
 
355 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  31.88 
 
 
360 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  33.89 
 
 
330 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  34.51 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  32.42 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  31.25 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  29.63 
 
 
340 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0129  transport system permease protein  32.69 
 
 
351 aa  136  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0463591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  32.54 
 
 
323 aa  135  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  30.21 
 
 
375 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  28.82 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  29.24 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  31.37 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  29.57 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  31.37 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  31.37 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  31.1 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  30.93 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  27.59 
 
 
336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  31.13 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  28.57 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  32.21 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  33.22 
 
 
337 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  33.92 
 
 
338 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  32.69 
 
 
380 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  32.15 
 
 
363 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1117  transport system permease protein  32.48 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  30.79 
 
 
376 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  30.03 
 
 
346 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  29.69 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  30.92 
 
 
363 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  30.13 
 
 
374 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  31.91 
 
 
363 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  30.6 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.03 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  30.62 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  30.18 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  30.84 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  32.48 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  28.4 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  28.44 
 
 
357 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  31.61 
 
 
345 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>