More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0082 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  100 
 
 		 322 aa  624  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  62.62 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  50.32 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  47.95 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  49.36 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  47.34 
 
 		 359 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  50.16 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  47.65 
 
 		 371 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  44.48 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  44.97 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  43.67 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  43.08 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  42.04 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  46.08 
 
 		 374 aa  242  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  42.32 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  41.36 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  42.86 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  41.14 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  36.14 
 
 		 349 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.4 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  34.81 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  37.78 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  32.62 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.15 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  34.06 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  34.06 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  34.06 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  34.27 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0129  transport system permease protein  35.55 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0463591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  35.69 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  34.51 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  32.81 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  33.45 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.49 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  34.27 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  32.61 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  34.27 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  34.27 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  34.27 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  34.27 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  32.49 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  32.42 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  35.27 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  33.23 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  35.33 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  31.48 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  32.42 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  34 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01680  vtamin B12-transporter permease  34.62 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1931  transport system permease protein  34.62 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00205827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1479  vtamin B12-transporter permease  34.62 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.950653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01669  hypothetical protein  34.62 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.028051  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1915  vtamin B12-transporter permease  34.62 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1920  vtamin B12-transporter permease  34.62 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1791  vtamin B12-transporter permease  34.62 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.979653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  31.11 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  32.7 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1509  transport system permease protein  32.43 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1930  vtamin B12-transporter permease  34.27 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226641  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  33.76 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  30.77 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  32.82 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0113  transport system permease protein  35 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  29.41 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  33.44 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  32.76 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  33.02 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  31.85 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2429  vtamin B12-transporter permease  34.62 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  32.41 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  32.03 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  32.81 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  29.58 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  30.48 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  31.33 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  33.55 
 
 		 346 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  31.87 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.18 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  33.65 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  32.83 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  32.92 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  32.08 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  32.08 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  33.44 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  32.08 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  29.91 
 
 		 370 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02132  vtamin B12-transporter permease  34.66 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  34.78 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.28 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  29.71 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  30.25 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  29.61 
 
 		 452 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  31.49 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  31.76 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  32.92 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  32.52 
 
 		 381 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  33.44 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  31.31 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  30.99 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>