More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0747 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 343 aa  665    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.5 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  43.27 
 
 		 348 aa  258  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  36.53 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  41.43 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  43.81 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  42.81 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  36.05 
 
 		 391 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  36.68 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  36.23 
 
 		 371 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  35.94 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  36 
 
 		 340 aa  198  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  36.42 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  35.86 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  35.65 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  33.33 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  34.99 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  37.63 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  32.62 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  34.6 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  34.6 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  35.86 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  31.61 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  31.61 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  31.61 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  32.25 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  32.08 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  34.97 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  33.92 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  32.57 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  31.12 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  30.79 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  31.07 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  33.63 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  33.23 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  32.38 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  32.84 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  32.16 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.38 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  31.74 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.47 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  32.6 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  29.6 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  31.53 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  35.96 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  34.38 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  31.79 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  31.76 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  34.08 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  28.12 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  33.56 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  30.43 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  30.43 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  30.43 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  34.14 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  32.5 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  31.56 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  31.74 
 
 		 357 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  32.32 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  29.91 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  30.89 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  29.91 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  29.18 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  30.6 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  33.21 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  33.21 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  33.21 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  33.21 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  33.33 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  29.79 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  33.56 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  33.21 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  29.08 
 
 		 356 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  34.05 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  31.46 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  33.45 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  30.58 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  30.25 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  31.97 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  30.48 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  33.33 
 
 		 361 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.22 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  29.06 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  30 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  32.48 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  30.31 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0864  vtamin B12-transporter permease  34.02 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  32.64 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  32.27 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  29.51 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  29.56 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  30.77 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>