More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3529 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  51.84 
 
 		 238 aa  276  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  51.44 
 
 		 239 aa  265  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  54.47 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  50.21 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  52.65 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  44.9 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  42.28 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  41.87 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  42.97 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  39.76 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  38.96 
 
 		 248 aa  174  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  36.69 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  37.05 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  36.25 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 		 269 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  35.51 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  33.19 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  33.03 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  35.02 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  35.14 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  33.04 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  32.79 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  34.55 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  34.11 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  32.68 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  31.97 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  29.52 
 
 		 291 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  33.17 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  31.96 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  33.18 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  31.05 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  32.51 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  32.11 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  34.62 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  30.11 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  32.2 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 267 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  32.38 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  35.15 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  34.31 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  32.37 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  30.24 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  30.23 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  32 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  30.14 
 
 		 300 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  30.23 
 
 		 267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  32.42 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  30.35 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  29.67 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  29.77 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  30.11 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  30 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  28.08 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  30.69 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  32.37 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  32.26 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  31.48 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  30.6 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  30.52 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  31.58 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  29.7 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  30.29 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  30.14 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  33.03 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  29.13 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  30.73 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  31.69 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  32.2 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  29.85 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  29.85 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  30.69 
 
 		 270 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  30.39 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  31.58 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  28.24 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  31.58 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  31.22 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  30.42 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  30.81 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  29.3 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  30.43 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  30.2 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  29.5 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  29.35 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>