More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0475 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  94.49 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  64.43 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  66.27 
 
 		 252 aa  342  4e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  59.52 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  60.08 
 
 		 254 aa  318  6e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  50.39 
 
 		 257 aa  235  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  43.13 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  45.35 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  44.61 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 270 aa  201  7e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  40.81 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  39.11 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  40.24 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  41.83 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  41.34 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 274 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  38.75 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  40.75 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  37.17 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  38.29 
 
 		 267 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  39.53 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  38.72 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  40.66 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  40.22 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  36.8 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  40.22 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  38.97 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  38.81 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  36.7 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  38.15 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>