More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2084 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  74.19 
 
 		 248 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  70.85 
 
 		 248 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  68.83 
 
 		 248 aa  354  6.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  67.21 
 
 		 248 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  68.02 
 
 		 248 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  64.92 
 
 		 249 aa  332  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  39.29 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  36.69 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  36.07 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  35.89 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  34.43 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  34.15 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  35.08 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  33.61 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  32.66 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  30.77 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  32.8 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  33.03 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  36.32 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  32.51 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  33.58 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  35.65 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0370  dihydrodipicolinate reductase  32.17 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  35.68 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  31.08 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  30.42 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  30.65 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  30.53 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  27.64 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  30.42 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  29.5 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  30.19 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  31.4 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  35.27 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  31.03 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  29.41 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  31.03 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  33.17 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  31.03 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  34.58 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  37.56 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  31.45 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  28.74 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  32.51 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  33.65 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  33.66 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  34.33 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  33 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  32.5 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  32 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  34.42 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  33.05 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  31.4 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  33.03 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  31.53 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  32.41 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  34.17 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  33.65 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  30.52 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  28.52 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  33.99 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  33.97 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  33.65 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  29.75 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  29.75 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  32.35 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  32.35 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  34.3 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  33.17 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  33.01 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  30.77 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  32.35 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  34.3 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  33.17 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  32.35 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  35.55 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>