More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0173 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  62.75 
 
 		 254 aa  332  3e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  61.26 
 
 		 255 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  61.96 
 
 		 254 aa  315  4e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  58.04 
 
 		 258 aa  304  8.000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  56.86 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  56.2 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  55.81 
 
 		 242 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  55.04 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  54.9 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  45.02 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  47.66 
 
 		 267 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  41.85 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  42.64 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  41.13 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 270 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  40.38 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  42.21 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  48.06 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  40.81 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  41 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  41 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  41 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  44.5 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  49.22 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  39.48 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  38.81 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  38.29 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  38.49 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  38.26 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  40.64 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  38.29 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  38.97 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  38.29 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  40.84 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  39.34 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  39.19 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 273 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  41.41 
 
 		 241 aa  178  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  38.85 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>