More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0974 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  81.48 
 
 		 274 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  80 
 
 		 271 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  80.37 
 
 		 270 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  80.74 
 
 		 270 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  80.74 
 
 		 270 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  80 
 
 		 271 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  78.89 
 
 		 271 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  81.11 
 
 		 270 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  80.37 
 
 		 270 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  78.89 
 
 		 270 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  78.89 
 
 		 270 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  78.89 
 
 		 270 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  78.89 
 
 		 270 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  78.89 
 
 		 270 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  75.19 
 
 		 270 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  67.67 
 
 		 273 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  65.67 
 
 		 273 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  65.43 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  64.55 
 
 		 273 aa  364  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  65.67 
 
 		 273 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  65.67 
 
 		 273 aa  358  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  64.18 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  64.18 
 
 		 273 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  63.81 
 
 		 273 aa  355  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  65.91 
 
 		 267 aa  355  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  63.43 
 
 		 273 aa  353  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  63.81 
 
 		 273 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  63.81 
 
 		 273 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  63.81 
 
 		 273 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  64.18 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  65.3 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  64.93 
 
 		 273 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  65.3 
 
 		 273 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  65.3 
 
 		 273 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  65.3 
 
 		 273 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  64.93 
 
 		 273 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  65.3 
 
 		 273 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  64.93 
 
 		 273 aa  349  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  64.93 
 
 		 273 aa  348  8e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 		 266 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  62.55 
 
 		 268 aa  341  9e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 270 aa  340  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  59.77 
 
 		 269 aa  337  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  59.77 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  59.77 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  60 
 
 		 268 aa  329  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  60.38 
 
 		 267 aa  328  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  59.25 
 
 		 271 aa  328  7e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  60.75 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  60.75 
 
 		 267 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  59.62 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  60.38 
 
 		 267 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  60 
 
 		 267 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  59.25 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  57.95 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  57.52 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  59.4 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  59.4 
 
 		 268 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  59.4 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  56.6 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  57.25 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  58.27 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  57.14 
 
 		 264 aa  305  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  55.22 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  56.02 
 
 		 276 aa  298  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  54.48 
 
 		 268 aa  298  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  54.48 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  54.48 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  54.48 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  54.48 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  58.05 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 268 aa  294  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  54.1 
 
 		 268 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  54.1 
 
 		 268 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  56.02 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  55.26 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 282 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1729  dihydrodipicolinate reductase  55.97 
 
 		 268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  54.72 
 
 		 271 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  57.95 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  53.9 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 		 266 aa  285  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 		 265 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  53.21 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>