More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2747 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  70.25 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0204  dihydrodipicolinate reductase  59.13 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 288 aa  230  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 289 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  50.96 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  55.79 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  61.46 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  56.88 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  51.72 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  52.11 
 
 		 271 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  54 
 
 		 269 aa  208  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  58.62 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  47.89 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  51.34 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  54 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  53.27 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  47.66 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  47.51 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  59.11 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  53 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  53 
 
 		 269 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  45.95 
 
 		 256 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  49.05 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  47.71 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  48.85 
 
 		 272 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  53.23 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  46.43 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1055  dihydrodipicolinate reductase  48.75 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  42.97 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  40.74 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  40.74 
 
 		 242 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 269 aa  187  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  40.68 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  45.2 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  45.63 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  45.83 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  42.21 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  41.83 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  41.83 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  41.83 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  41.83 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  41.6 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  41.06 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  48.62 
 
 		 268 aa  181  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  41.15 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  45.27 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 274 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 270 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  41.41 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 		 276 aa  177  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  50.51 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  46.25 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  40.68 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  40.65 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  40.68 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  45.16 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>