More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0237 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 270 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  77.24 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  76.87 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  72.93 
 
 		 272 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  69.78 
 
 		 279 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  71.6 
 
 		 277 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  69.4 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  67.91 
 
 		 277 aa  349  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  66.92 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  66.54 
 
 		 267 aa  342  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  66.54 
 
 		 267 aa  342  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  65.41 
 
 		 265 aa  337  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  63.91 
 
 		 265 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  63.91 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  65.04 
 
 		 265 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  61.65 
 
 		 272 aa  315  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  60.45 
 
 		 271 aa  308  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  60.98 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  60.98 
 
 		 269 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  60.98 
 
 		 269 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  59.09 
 
 		 269 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  56.77 
 
 		 272 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  55.22 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  56.44 
 
 		 268 aa  278  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  56.55 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  57.3 
 
 		 271 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 288 aa  274  9e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  55.26 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  54.55 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  56.55 
 
 		 271 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  55.26 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  55.81 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  53.38 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  50.37 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 263 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  48.51 
 
 		 266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  46.64 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 273 aa  231  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  48.12 
 
 		 273 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  49.64 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  46.64 
 
 		 273 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  47.19 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 267 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  46.88 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  46.99 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  46.82 
 
 		 266 aa  224  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  45.52 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  45.52 
 
 		 273 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  45.9 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  46.82 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 278 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 265 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2289  Dihydrodipicolinate reductase  48.67 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2663  dihydrodipicolinate reductase  48.67 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  43.35 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  42.97 
 
 		 278 aa  214  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  43.17 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  43.82 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>