More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3371 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 272 aa  534  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  76.38 
 
 		 274 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  77.86 
 
 		 274 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  72.59 
 
 		 279 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  73.41 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  72.93 
 
 		 270 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  70.43 
 
 		 277 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  73.13 
 
 		 277 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  68.05 
 
 		 267 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  68.05 
 
 		 267 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  68.05 
 
 		 267 aa  342  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  65.54 
 
 		 272 aa  341  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  66.92 
 
 		 265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  63.91 
 
 		 265 aa  325  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  62.45 
 
 		 271 aa  325  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  66.54 
 
 		 265 aa  324  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  60.97 
 
 		 271 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  58.71 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  57.95 
 
 		 268 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  58.71 
 
 		 269 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  58.71 
 
 		 269 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  53.56 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  58.33 
 
 		 269 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  54.1 
 
 		 272 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  55.22 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  55.81 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  57.46 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  58.21 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  54.1 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  54.31 
 
 		 289 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  56.72 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  58.21 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  53.41 
 
 		 269 aa  268  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 266 aa  232  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  45.96 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  46.69 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  45.59 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  46.69 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  45.59 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  46.99 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  46.32 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  48.55 
 
 		 274 aa  221  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  46.15 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  46.15 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  46.15 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  46.15 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  48.7 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  47.27 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  46.99 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  44.78 
 
 		 268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  44.78 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  44.78 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  45.79 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  46.82 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  47.94 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 		 268 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 		 268 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>