More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2507 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 267 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 267 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  95.13 
 
 		 267 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  78.87 
 
 		 265 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  78.49 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  76.98 
 
 		 265 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  67.79 
 
 		 279 aa  349  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  67.79 
 
 		 268 aa  348  7e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  65.66 
 
 		 271 aa  344  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  66.54 
 
 		 270 aa  342  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  66.28 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  62.26 
 
 		 288 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  64.04 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  61.8 
 
 		 289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  68.05 
 
 		 272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  67.29 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  65.79 
 
 		 274 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  60.67 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  66.04 
 
 		 277 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  61.05 
 
 		 271 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  61.42 
 
 		 271 aa  311  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  64.15 
 
 		 271 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  63.4 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  60.84 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  60.46 
 
 		 269 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  63.5 
 
 		 269 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  62.17 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  63.12 
 
 		 269 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  62.36 
 
 		 269 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  55.22 
 
 		 268 aa  292  5e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  58.56 
 
 		 269 aa  292  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  58.8 
 
 		 300 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  58.49 
 
 		 269 aa  288  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  56.23 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 268 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  46.67 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  58.96 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  46.59 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 273 aa  224  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  47.84 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  48.13 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  45.56 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  46.99 
 
 		 269 aa  221  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 268 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 		 276 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 263 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 273 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  44.78 
 
 		 265 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  44.15 
 
 		 270 aa  214  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>