More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0212 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  95.49 
 
 
266 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  91.73 
 
 
266 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  85.39 
 
 
267 aa  461  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  81.65 
 
 
267 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  83.52 
 
 
267 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  83.52 
 
 
267 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  73.41 
 
 
267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  58.05 
 
 
267 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  57.84 
 
 
268 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  58.8 
 
 
267 aa  308  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  57.84 
 
 
268 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  59.7 
 
 
268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  57.52 
 
 
267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  57.68 
 
 
267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  57.68 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  57.89 
 
 
267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  57.3 
 
 
267 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  56.55 
 
 
267 aa  298  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  56.55 
 
 
267 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  55.47 
 
 
270 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  57.3 
 
 
270 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  57.3 
 
 
270 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  54.89 
 
 
271 aa  292  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  57.3 
 
 
270 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  53.58 
 
 
271 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 
266 aa  288  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 
267 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
270 aa  285  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 
271 aa  284  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  53.58 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  53.21 
 
 
270 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
270 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  53.38 
 
 
274 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
270 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
270 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
270 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
270 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  54.31 
 
 
269 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  54.85 
 
 
268 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  53.18 
 
 
269 aa  278  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  53.38 
 
 
269 aa  278  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  52.06 
 
 
267 aa  278  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 
266 aa  276  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
268 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  51.7 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  52.24 
 
 
269 aa  271  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 
268 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  50.56 
 
 
269 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
270 aa  265  7e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 
269 aa  265  8e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 
273 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 
273 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
269 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 
273 aa  262  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 
273 aa  262  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 
268 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  48.12 
 
 
268 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  51.69 
 
 
264 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  50.56 
 
 
284 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 
267 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 
273 aa  258  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 
273 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
263 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
273 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 
265 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
263 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  53.21 
 
 
267 aa  254  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  53.93 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  51.7 
 
 
273 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 
263 aa  251  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 
265 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 
273 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  47.94 
 
 
276 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 
276 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 
269 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 
259 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
273 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
273 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 
265 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 
273 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 
273 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 
273 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
273 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
273 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
273 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 
267 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
273 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 
273 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  47.94 
 
 
278 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 
265 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 
273 aa  245  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  49.43 
 
 
273 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 
273 aa  245  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 
265 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 
265 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>