More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0004 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 242 aa  473  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  70.25 
 
 		 241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0204  dihydrodipicolinate reductase  59.06 
 
 		 252 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  51.14 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 288 aa  218  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  46.77 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  46.77 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  46.59 
 
 		 289 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 272 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  45.63 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  47.15 
 
 		 269 aa  204  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  45.25 
 
 		 269 aa  201  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 		 274 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 		 279 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  51.17 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 271 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  46.01 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  54.88 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  47.6 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1055  dihydrodipicolinate reductase  48.96 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  43.75 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 268 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  42.39 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  42.39 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 271 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  40.24 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  41.67 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  41.98 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  41.08 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  41.29 
 
 		 267 aa  184  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  184  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  45.25 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  41.15 
 
 		 242 aa  184  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 274 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  46 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  41.89 
 
 		 268 aa  181  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 271 aa  181  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  43.78 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 		 267 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  38.78 
 
 		 268 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 		 267 aa  177  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  38.78 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  38.78 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  38.78 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 		 276 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  41.67 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>