More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0228 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
242 aa  497  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  99.17 
 
 
242 aa  493  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  97.5 
 
 
248 aa  482  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  71.49 
 
 
242 aa  355  2.9999999999999997e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  62.2 
 
 
256 aa  322  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  65.35 
 
 
254 aa  318  6e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  60.47 
 
 
258 aa  315  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  60.24 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  58.43 
 
 
255 aa  300  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  55.81 
 
 
255 aa  281  6.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  46.5 
 
 
246 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 
269 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  38.72 
 
 
267 aa  188  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  40.74 
 
 
241 aa  188  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
244 aa  188  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 
267 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 
269 aa  188  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 
268 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 
269 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 
268 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 
268 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 
267 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 
267 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  37.59 
 
 
276 aa  184  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 
270 aa  184  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  39.39 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  42.39 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  38.31 
 
 
264 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  38.26 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  39.53 
 
 
263 aa  182  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 
267 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 
278 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 
273 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 
270 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 
259 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 
273 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 
268 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  38.87 
 
 
273 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
270 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 
268 aa  175  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 
267 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
270 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
270 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  39.53 
 
 
261 aa  174  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
273 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
273 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  42.72 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
275 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 
270 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 
265 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 
269 aa  171  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  39.16 
 
 
276 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 
271 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  38.26 
 
 
269 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 
267 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  36.98 
 
 
273 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 
265 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 
274 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  39.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 
273 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 
271 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 
267 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 
269 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 
266 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 
273 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 
265 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  38.34 
 
 
252 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 
265 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 
265 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 
265 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>