More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4967 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
274 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  57.81 
 
 
256 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  58.98 
 
 
256 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  49.64 
 
 
270 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 
300 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  50.18 
 
 
269 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  48.35 
 
 
269 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  49.82 
 
 
268 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  45.09 
 
 
268 aa  222  4e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  49.63 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  50.37 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2997  dihydrodipicolinate reductase  47.27 
 
 
274 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  49.26 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  48.53 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  48.16 
 
 
279 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 
277 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  49.63 
 
 
269 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  47.79 
 
 
268 aa  215  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  46.72 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  48.52 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  46.72 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  47.84 
 
 
274 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  48.55 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  47.43 
 
 
271 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  49.26 
 
 
288 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  48.13 
 
 
265 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  45.62 
 
 
267 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  47.41 
 
 
265 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  48.18 
 
 
272 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  45.52 
 
 
271 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  47.48 
 
 
274 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  47.78 
 
 
289 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  47.66 
 
 
241 aa  205  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  47.04 
 
 
265 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  44.07 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  46.74 
 
 
267 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 
269 aa  194  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 
269 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  40.71 
 
 
275 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  40.66 
 
 
267 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  47.78 
 
 
271 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  41.24 
 
 
269 aa  191  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  47.79 
 
 
268 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  42.07 
 
 
267 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  46.01 
 
 
267 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 
267 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  41.03 
 
 
267 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  43.75 
 
 
265 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  41.82 
 
 
269 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  42.07 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  39.36 
 
 
276 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  40.29 
 
 
266 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  42.07 
 
 
267 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
265 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 
269 aa  188  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  41.58 
 
 
273 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  46.67 
 
 
271 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  39.34 
 
 
267 aa  188  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  39.21 
 
 
278 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  46.69 
 
 
271 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  43.7 
 
 
263 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 
268 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  42.55 
 
 
266 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  43.7 
 
 
263 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  41.39 
 
 
271 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 
276 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  40.37 
 
 
267 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 
267 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 
271 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  40.86 
 
 
273 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  40.74 
 
 
267 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  41.97 
 
 
268 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 
265 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
268 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  43.01 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  49.03 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  41.61 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  43.49 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  43.97 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  39.64 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  41.85 
 
 
282 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  43.12 
 
 
264 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  46.3 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
268 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
268 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  43.01 
 
 
265 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
268 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
268 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 
267 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  47.6 
 
 
267 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  41.03 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  42.49 
 
 
267 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 
267 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>