More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4127 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
274 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  91.97 
 
 
274 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  77.24 
 
 
270 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  76.75 
 
 
279 aa  410  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  77.61 
 
 
268 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  77.86 
 
 
272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  76.65 
 
 
277 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  72.26 
 
 
277 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  66.92 
 
 
267 aa  345  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  66.92 
 
 
265 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  67.29 
 
 
267 aa  342  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  67.29 
 
 
267 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  65.41 
 
 
265 aa  338  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  64.68 
 
 
272 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  67.67 
 
 
265 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  63.2 
 
 
271 aa  323  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  59.11 
 
 
271 aa  304  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  56.72 
 
 
268 aa  296  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  58.3 
 
 
269 aa  292  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  58.33 
 
 
269 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  57.95 
 
 
269 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  58.65 
 
 
272 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  56.77 
 
 
271 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  56.93 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  56.06 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  56.82 
 
 
269 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  57.09 
 
 
288 aa  278  5e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  57.46 
 
 
289 aa  278  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  59.19 
 
 
271 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  58.09 
 
 
271 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  54.92 
 
 
269 aa  272  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  56.02 
 
 
300 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  56.99 
 
 
271 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 
265 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 
269 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 
268 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  46.69 
 
 
273 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 
268 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  47.43 
 
 
273 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 
267 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 
267 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 
267 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
273 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 
267 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
273 aa  228  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 
268 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 
273 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 
267 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  47.84 
 
 
274 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 
267 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 
256 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 
276 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  46.88 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  46.47 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 
270 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 
268 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 
268 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
270 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  44.28 
 
 
273 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  45.52 
 
 
267 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  47.04 
 
 
278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  44.65 
 
 
267 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 
273 aa  214  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  45.9 
 
 
266 aa  214  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  43.68 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  43.87 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 
269 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
266 aa  211  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  43.32 
 
 
273 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  43.32 
 
 
273 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  43.32 
 
 
273 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
270 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
267 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  44.03 
 
 
269 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
270 aa  208  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
270 aa  208  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 
267 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  46.99 
 
 
264 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  42.91 
 
 
269 aa  208  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  45.72 
 
 
270 aa  208  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
270 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 
241 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 
270 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>