More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0385 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 271 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  94.83 
 
 		 271 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  84.87 
 
 		 271 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  80.81 
 
 		 289 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  79.1 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  78.97 
 
 		 272 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  83.39 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  64.21 
 
 		 300 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  64.15 
 
 		 267 aa  325  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  64.15 
 
 		 267 aa  325  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  63.43 
 
 		 271 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  62.64 
 
 		 267 aa  318  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  60.82 
 
 		 271 aa  314  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  62.26 
 
 		 265 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  61.11 
 
 		 272 aa  310  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  60.07 
 
 		 279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  59.77 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  60.16 
 
 		 277 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  59.41 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  59.25 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  58.21 
 
 		 272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  55.81 
 
 		 270 aa  281  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  59.62 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  54.89 
 
 		 268 aa  278  7e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  57.72 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  56.99 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  54.28 
 
 		 269 aa  272  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  53.9 
 
 		 269 aa  268  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  53.16 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  52.79 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  52.42 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  51.7 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  45.9 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  44.15 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  51.34 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  42.91 
 
 		 269 aa  224  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  45.83 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 		 273 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  45.52 
 
 		 268 aa  221  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  45.19 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  45.83 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  45.83 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  46.18 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  45.59 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  44.81 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  43.77 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 		 273 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>