More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3040 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 269 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  76.78 
 
 		 269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  76.58 
 
 		 269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  75.47 
 
 		 268 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  78.07 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  77.7 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  78.07 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  63.12 
 
 		 265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  61.98 
 
 		 265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  61.74 
 
 		 271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  60 
 
 		 279 aa  304  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  59.62 
 
 		 268 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  60.94 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  60.46 
 
 		 267 aa  299  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  60.46 
 
 		 267 aa  299  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  60.84 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  58.94 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  59.09 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  57.25 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  58.17 
 
 		 265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  59.85 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  58.3 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  58.71 
 
 		 272 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  57.78 
 
 		 277 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  51.52 
 
 		 268 aa  275  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  53.99 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  57.03 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  52.47 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  54.75 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  51.71 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  54.28 
 
 		 271 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  53.16 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  52.79 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  52.47 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  52.09 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  52.47 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  52.09 
 
 		 265 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 267 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  49.05 
 
 		 267 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 273 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  51.33 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  49.05 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  47.91 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  51.33 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  51.33 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  51.33 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  51.33 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  51.33 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  51.33 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  47.15 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  51.33 
 
 		 265 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  49.26 
 
 		 271 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  48.29 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  48.89 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  47.15 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  47.91 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  47.91 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  50.18 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  48.28 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  47.91 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  46.77 
 
 		 266 aa  224  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  49.63 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  46.36 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  48.15 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  45.63 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  47.91 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  47.91 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  47.15 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  47.15 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  47.15 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  49.61 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3789  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  46.59 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>