More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0335 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  81.92 
 
 		 271 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  77.12 
 
 		 289 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  77.24 
 
 		 288 aa  417  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  82.66 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  83.39 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  76.01 
 
 		 272 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  62.73 
 
 		 300 aa  325  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  63.2 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  62.17 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  62.17 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  61.19 
 
 		 271 aa  314  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  61.05 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  61.48 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  60.75 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  60.08 
 
 		 277 aa  302  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  58.87 
 
 		 265 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  58.36 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  59.04 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  56.72 
 
 		 268 aa  295  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  57.3 
 
 		 270 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  58.05 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  57.46 
 
 		 272 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  60.75 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  59.19 
 
 		 274 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  58.09 
 
 		 274 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  52.79 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  53.23 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  52.42 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  52.42 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  52.42 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 268 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 265 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  51.3 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  48.13 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 265 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 		 267 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  45.56 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 268 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 268 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 267 aa  234  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  46.3 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  45.19 
 
 		 273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  46.99 
 
 		 265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  45.19 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  45.19 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  52.11 
 
 		 241 aa  231  9e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  44.03 
 
 		 269 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  45.19 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  45.42 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 273 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  45.25 
 
 		 278 aa  228  9e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  43.73 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  45.93 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>