More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0755 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
271 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3789  dihydrodipicolinate reductase  80.44 
 
 
271 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4608  dihydrodipicolinate reductase  82.26 
 
 
270 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.745671  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  78.74 
 
 
254 aa  414  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  75.67 
 
 
282 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  76.81 
 
 
276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  74.43 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  75.76 
 
 
284 aa  400  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  74.24 
 
 
273 aa  391  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  75 
 
 
273 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  70.83 
 
 
265 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  71.21 
 
 
265 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  70.83 
 
 
265 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  70.08 
 
 
265 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  70.83 
 
 
265 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  70.08 
 
 
265 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  70.08 
 
 
265 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  71.97 
 
 
265 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  67.05 
 
 
265 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  68.56 
 
 
268 aa  361  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  68.56 
 
 
268 aa  361  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  68.56 
 
 
265 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  67.42 
 
 
265 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  68.18 
 
 
268 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  68.18 
 
 
268 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  68.18 
 
 
268 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  68.18 
 
 
268 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  67.8 
 
 
268 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  66.29 
 
 
267 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  67.66 
 
 
278 aa  351  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  65.91 
 
 
265 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  65.91 
 
 
266 aa  348  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  63.53 
 
 
269 aa  347  9e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  66.54 
 
 
254 aa  345  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  64.39 
 
 
268 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  60.38 
 
 
267 aa  332  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  62.36 
 
 
263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  62.36 
 
 
263 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  63.12 
 
 
263 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  60.75 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  60.75 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  60.67 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  58.52 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  59.47 
 
 
273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  60.38 
 
 
273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  58.3 
 
 
273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  59.09 
 
 
273 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  59.09 
 
 
273 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  59.09 
 
 
273 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
273 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  56.98 
 
 
266 aa  298  5e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  57.52 
 
 
267 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  56.6 
 
 
269 aa  295  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  57.52 
 
 
267 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  57.74 
 
 
267 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
267 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  57.14 
 
 
267 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  58.27 
 
 
266 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  58.49 
 
 
273 aa  292  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  57.14 
 
 
267 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  56.39 
 
 
270 aa  291  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1729  dihydrodipicolinate reductase  61.74 
 
 
268 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  57.89 
 
 
267 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  56.23 
 
 
271 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  55.35 
 
 
273 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  54.72 
 
 
270 aa  288  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  56.25 
 
 
274 aa  288  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  55.35 
 
 
273 aa  288  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  55.35 
 
 
273 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  56.51 
 
 
268 aa  287  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  54.89 
 
 
267 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  55.47 
 
 
271 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  56.02 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  55.85 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  53.53 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
273 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  58.11 
 
 
273 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  55.3 
 
 
270 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 
273 aa  281  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  54.04 
 
 
271 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  56.02 
 
 
268 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  55.97 
 
 
268 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 
270 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 
270 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  58.49 
 
 
273 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
269 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  52.45 
 
 
269 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  58.27 
 
 
273 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  55.09 
 
 
269 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  55.97 
 
 
268 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  53.96 
 
 
270 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 
270 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 
270 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  54.72 
 
 
270 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  54.72 
 
 
270 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>