More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2959 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
272 aa  532  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  71.38 
 
 
271 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  68.68 
 
 
265 aa  346  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  65.17 
 
 
279 aa  335  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  65.04 
 
 
268 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  64.04 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  64.04 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  64.04 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  64.15 
 
 
265 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  65.54 
 
 
272 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  63.57 
 
 
277 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  65.66 
 
 
265 aa  321  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  64.71 
 
 
277 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  64.68 
 
 
274 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  64.66 
 
 
274 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  61.65 
 
 
270 aa  315  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  59.63 
 
 
271 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  59.55 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  59.7 
 
 
289 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  61.85 
 
 
271 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  61.48 
 
 
271 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  57.52 
 
 
288 aa  292  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  57.41 
 
 
272 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  61.11 
 
 
271 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  58.94 
 
 
269 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  54.1 
 
 
268 aa  289  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  58.21 
 
 
300 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  58.17 
 
 
269 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  58.17 
 
 
269 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  57.79 
 
 
269 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  55.13 
 
 
268 aa  275  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  53.61 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  55.22 
 
 
269 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 
267 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  51.7 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 
267 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 
268 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 
268 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 
267 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  48.67 
 
 
267 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 
267 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  47.6 
 
 
269 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 
273 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 
269 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  47.39 
 
 
273 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 
266 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 
267 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 
268 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 
273 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 
269 aa  224  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 
266 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 
269 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  47.19 
 
 
273 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 
269 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  47.04 
 
 
268 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  44.53 
 
 
266 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  43.82 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  44.15 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 
265 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  46.3 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  46.3 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  52.06 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 
267 aa  218  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  51.69 
 
 
270 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 
265 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 
267 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 
273 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 
265 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  45.93 
 
 
268 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  45.93 
 
 
268 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  45.93 
 
 
268 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 
267 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  45.93 
 
 
268 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 
273 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 
265 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 
273 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 
267 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 
265 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  47.45 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  45.35 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  44.53 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>