More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0114 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 265 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  78.87 
 
 		 267 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  78.87 
 
 		 267 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  79.25 
 
 		 267 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  73.58 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  72.83 
 
 		 265 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  66.54 
 
 		 279 aa  338  7e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  66.54 
 
 		 268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  63.91 
 
 		 270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  64.15 
 
 		 272 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 		 271 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  65.41 
 
 		 274 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  64.45 
 
 		 277 aa  321  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  65.79 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 		 272 aa  315  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  64.77 
 
 		 277 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  60.75 
 
 		 289 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  61.28 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  63.91 
 
 		 272 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  59.25 
 
 		 288 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  62.26 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  57.14 
 
 		 268 aa  302  5.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  57.74 
 
 		 271 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  58.56 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  62.26 
 
 		 271 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  59.32 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  59.7 
 
 		 269 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  55.51 
 
 		 269 aa  285  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  58.94 
 
 		 269 aa  284  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  58.17 
 
 		 269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  57.36 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  58.87 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  56.98 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  54.34 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 275 aa  241  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  49.05 
 
 		 267 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 273 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 273 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 268 aa  238  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  47.13 
 
 		 278 aa  231  9e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  46.36 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  48.62 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  43.4 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  44.53 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 265 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 270 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 		 273 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  43.4 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  47.55 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  43.56 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>