More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2555 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 256 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  90.23 
 
 		 256 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  57.81 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  51.1 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  47.76 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  49.08 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2997  dihydrodipicolinate reductase  47.99 
 
 		 274 aa  218  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  46.86 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  47.94 
 
 		 265 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  47.97 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  48.7 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  48.52 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  49.08 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1055  dihydrodipicolinate reductase  47.66 
 
 		 247 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  46.67 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  47.19 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  45.95 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  42.22 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  54.82 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  40.58 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  46.84 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  42.54 
 
 		 268 aa  195  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 270 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 269 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 270 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  40.24 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 		 271 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  45.22 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  42.16 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  48.21 
 
 		 242 aa  188  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 269 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  44.61 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  44.61 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  40.22 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 267 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  41.64 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  41.64 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  42.35 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 		 275 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  38.75 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  37.94 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  41.25 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  40.59 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  41.13 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>