More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2997 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2997  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
274 aa  538  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  48.72 
 
 
256 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  47.27 
 
 
274 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  47.99 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 
271 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  43.38 
 
 
300 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  41.64 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 
276 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  39.63 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 
267 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  40.59 
 
 
265 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 
265 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 
267 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  36.57 
 
 
278 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  38.81 
 
 
275 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  40.59 
 
 
265 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 
265 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 
272 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 
265 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 
265 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  39.26 
 
 
268 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 
265 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 
269 aa  182  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  42.54 
 
 
265 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 
267 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 
267 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 
268 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 
268 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  36.94 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 
265 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  37.13 
 
 
274 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  36.57 
 
 
269 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  36.94 
 
 
265 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  36.19 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 
268 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 
268 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 
267 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 
268 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 
268 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  36.57 
 
 
269 aa  178  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 
267 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  37.87 
 
 
268 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  40.88 
 
 
272 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  43.12 
 
 
272 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 
267 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 
267 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 
268 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 
270 aa  175  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  38.24 
 
 
270 aa  175  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
269 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 
270 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  36.4 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  38.15 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  34.33 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  40.94 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  34.33 
 
 
267 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 
270 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 
270 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 
270 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 
254 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  41.09 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  36.4 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 
278 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 
267 aa  171  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  34.7 
 
 
266 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  37.13 
 
 
271 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  40.93 
 
 
277 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  47.78 
 
 
242 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 
268 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 
268 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 
269 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  35.21 
 
 
266 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 
269 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  37.08 
 
 
276 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  33.58 
 
 
267 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 
263 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  43.12 
 
 
260 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>