More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2422 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  73.78 
 
 		 266 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  73.41 
 
 		 266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  73.78 
 
 		 266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  71.54 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  70.79 
 
 		 267 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  70.41 
 
 		 267 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  69.29 
 
 		 267 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  56.18 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  58.43 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  57.68 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  57.3 
 
 		 270 aa  304  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  57.68 
 
 		 270 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  56.77 
 
 		 267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  57.68 
 
 		 270 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  56.02 
 
 		 267 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  56.39 
 
 		 266 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  57.78 
 
 		 268 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  55.81 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  55.81 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  55.43 
 
 		 267 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  56.34 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  56.34 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  56.39 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  54.68 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  54.89 
 
 		 271 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 		 266 aa  291  8e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 270 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 270 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 270 aa  291  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 270 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  53.96 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  53.96 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  53.96 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  53.96 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 		 271 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  53.58 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 		 274 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  53.38 
 
 		 270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  52.45 
 
 		 268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 		 273 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  51.69 
 
 		 269 aa  278  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 		 265 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  51.69 
 
 		 269 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  52.43 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  53.96 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  53.56 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 273 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 273 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  52.24 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  53.21 
 
 		 273 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 273 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  55.47 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  52.45 
 
 		 273 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  52.65 
 
 		 276 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 273 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 273 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 273 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  53.38 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 266 aa  265  8e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 273 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  53.93 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  50.93 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  53.21 
 
 		 263 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  53.21 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>