More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3042 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  91.73 
 
 		 266 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  92.11 
 
 		 266 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  83.9 
 
 		 267 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  80.15 
 
 		 267 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  81.65 
 
 		 267 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  81.65 
 
 		 267 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  73.78 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  56.34 
 
 		 268 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  56.34 
 
 		 268 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  58.58 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  56.18 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  56.18 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  55.43 
 
 		 267 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  55.43 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  55.06 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  56.18 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  54.89 
 
 		 267 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  56.18 
 
 		 270 aa  294  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  56.18 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  55.81 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  55.26 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  54.31 
 
 		 267 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 		 270 aa  291  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  54.89 
 
 		 266 aa  288  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  53.18 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  53.58 
 
 		 268 aa  285  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 271 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  54.48 
 
 		 268 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  52.06 
 
 		 269 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  51.31 
 
 		 269 aa  275  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 274 aa  271  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 273 aa  265  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 270 aa  265  7e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 		 268 aa  265  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 273 aa  265  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  50.93 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  55.43 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  48.12 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  50.76 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  48.69 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 		 273 aa  258  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 		 273 aa  258  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  51.12 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 265 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  48.69 
 
 		 267 aa  254  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 		 263 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 282 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  48.12 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 267 aa  248  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  51.52 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  48.12 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4608  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 273 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>