More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1971 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1055  dihydrodipicolinate reductase  61.18 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  46.99 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  45.35 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  45.39 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  43.01 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  45.21 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  51 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  43.97 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  43.58 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  43.35 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  48.73 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  42.35 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  39.34 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  42.54 
 
 		 267 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  40.51 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  43.35 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  39.37 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  43.17 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  41.67 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  43.87 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  51.78 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  43.87 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  40.96 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  52.04 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  44.15 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  44.03 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  40.96 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  41.76 
 
 		 278 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  41.89 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  51.02 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  51.52 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  41.89 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  41.89 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  43.78 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  43.4 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  41.9 
 
 		 246 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  50.97 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  41.89 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  40.66 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  45.16 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 275 aa  175  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 		 269 aa  174  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  41.51 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  48.98 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  44.53 
 
 		 267 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  41.64 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  41.51 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>