More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1409 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  71.49 
 
 		 242 aa  355  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  71.49 
 
 		 242 aa  355  5e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  71.01 
 
 		 248 aa  349  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  60.24 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  59.84 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  62.2 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  58.89 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  58.82 
 
 		 255 aa  301  5.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  56.2 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  44.03 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  42.15 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  43.54 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  46.6 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 276 aa  187  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  44.66 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  38.64 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  41.15 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  41.15 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 		 270 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 		 270 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 		 270 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 		 270 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  36.88 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  38.26 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  44.67 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  44.16 
 
 		 270 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  44.95 
 
 		 266 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  42.25 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  36.98 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  39.42 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  43.81 
 
 		 268 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  40.16 
 
 		 263 aa  174  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  42.51 
 
 		 267 aa  174  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  38.26 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  38.26 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  38.26 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  37.59 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  41.13 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  44.16 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  39.04 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  43.15 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  38.76 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  43.33 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  44.28 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 268 aa  171  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  38.72 
 
 		 267 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  42.72 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  45.27 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  37.35 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  36.67 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  45.27 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  36.67 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  39.6 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  41.83 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  42.72 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  43.08 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  41.62 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  41.43 
 
 		 273 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  39.45 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 		 266 aa  167  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  38.7 
 
 		 260 aa  167  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  39.04 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  38.87 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  42.93 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  39.36 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>