More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1424 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  64.48 
 
 		 259 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  63.71 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  61.39 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  56.76 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  54.69 
 
 		 263 aa  295  6e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  48.5 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 267 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  48.09 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  45.83 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  46.51 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  49.44 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  45.83 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  44.66 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 		 270 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  44.15 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  44.61 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  42.97 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  53.33 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  43.56 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  42.37 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  42.37 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  42.37 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  42.37 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  42.37 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  42.37 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  41.98 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  41.98 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  41.76 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 282 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 		 269 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  41.51 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  50.77 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  41.06 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  47.69 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  46.7 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  43.18 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  41.6 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  43.63 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  42.15 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  42.97 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  39.77 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  49.22 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2289  Dihydrodipicolinate reductase  53.57 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2663  dihydrodipicolinate reductase  53.57 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  42.23 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  42.21 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  42.21 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  43.08 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  40.61 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  41.51 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>