More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2077 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 261 aa  533  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  62.89 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  58.69 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  56.76 
 
 		 259 aa  316  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  58.69 
 
 		 259 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  57.14 
 
 		 259 aa  305  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  47.15 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  43.82 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  42.64 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  42.64 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.89 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 266 aa  215  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  40.88 
 
 		 269 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 267 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  41.29 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  43.51 
 
 		 267 aa  204  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 		 267 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  42.64 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  42.54 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  38.66 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  39.39 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  48.13 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  42.21 
 
 		 271 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 		 273 aa  198  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  44.02 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  43.8 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  41.85 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2663  dihydrodipicolinate reductase  43.4 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2289  Dihydrodipicolinate reductase  43.4 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238746 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  44.23 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  40.84 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  43.18 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  43.08 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  42.97 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>