More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0825 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
257 aa  510  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  54.75 
 
 
263 aa  293  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  54.2 
 
 
263 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  55.12 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  51.97 
 
 
255 aa  249  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  49.61 
 
 
251 aa  241  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  48.25 
 
 
254 aa  240  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  50.39 
 
 
254 aa  235  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  48.44 
 
 
254 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
270 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  44.81 
 
 
270 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
270 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
270 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  44.81 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  44.78 
 
 
268 aa  205  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
271 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  42.91 
 
 
267 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 
284 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 
267 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  46.32 
 
 
267 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 
267 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  46.64 
 
 
267 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  45.9 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  42.54 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 
267 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  46.64 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 
276 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  46.1 
 
 
267 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 
267 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 
266 aa  197  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 
271 aa  198  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  47.37 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  43.33 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  46.25 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  45.72 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 
270 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  43.7 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  42.22 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  45.52 
 
 
267 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  45.86 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
263 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
270 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 
278 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 
263 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  45.93 
 
 
267 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
271 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  45.05 
 
 
271 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 
269 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 
268 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 
274 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  44.12 
 
 
267 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  41.67 
 
 
266 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  44.23 
 
 
261 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
270 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
270 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
270 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
270 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  45.26 
 
 
268 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4608  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 
270 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.745671  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 
282 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  43.18 
 
 
269 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 
266 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 
270 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  44.61 
 
 
276 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 
269 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 
273 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  41.3 
 
 
268 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  44.81 
 
 
268 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 
278 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
265 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 
263 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3789  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 
271 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  43.46 
 
 
262 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  42.54 
 
 
273 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 
269 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 
268 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 
269 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 
265 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  40.52 
 
 
269 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  42.96 
 
 
266 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 
265 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
269 aa  184  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  44.03 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>