More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0730 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
270 aa  543  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  89.63 
 
 
270 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  89.63 
 
 
270 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  86.3 
 
 
270 aa  475  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  74.63 
 
 
273 aa  409  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  51.67 
 
 
263 aa  254  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  47.94 
 
 
263 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 
267 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
267 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  46.32 
 
 
270 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 
267 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  43.59 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  45.22 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 
267 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  45.22 
 
 
270 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  45.22 
 
 
270 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
257 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
269 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  45.02 
 
 
267 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  43.96 
 
 
267 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  43.96 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  45.22 
 
 
270 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
271 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  42.49 
 
 
267 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  44.07 
 
 
268 aa  214  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  43.59 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  43.01 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  43.96 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  43.96 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  43.49 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  43.59 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  41.09 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  43.38 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
270 aa  211  9e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  43.17 
 
 
274 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
270 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  43.43 
 
 
268 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  43.43 
 
 
268 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  43.96 
 
 
284 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  43.38 
 
 
265 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  42.44 
 
 
266 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  43.17 
 
 
273 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  42.49 
 
 
269 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  44.98 
 
 
251 aa  205  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 
271 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 
273 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
271 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  41.39 
 
 
269 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
265 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  42.49 
 
 
269 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
265 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  41.45 
 
 
269 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
265 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
270 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
265 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
265 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
270 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
270 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 
254 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
265 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  40.51 
 
 
276 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  43.43 
 
 
268 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
265 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
267 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 
254 aa  201  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
265 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  41.7 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  41.7 
 
 
268 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
265 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 
255 aa  198  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 
273 aa  198  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
265 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  41.7 
 
 
268 aa  198  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  40.81 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
270 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  41.09 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  40.22 
 
 
282 aa  195  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  40.81 
 
 
273 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4608  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 
270 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.745671  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 
273 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>