More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1493 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  65.22 
 
 
255 aa  349  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  65.61 
 
 
252 aa  349  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  61.66 
 
 
251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  60.08 
 
 
254 aa  318  6e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  57.71 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  51.71 
 
 
263 aa  265  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  48.25 
 
 
257 aa  240  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  45.21 
 
 
263 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 
270 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 
270 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 
270 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 
270 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  42.52 
 
 
252 aa  191  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  40.52 
 
 
268 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 
267 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  40.74 
 
 
269 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 
267 aa  184  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  39.63 
 
 
267 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  38.04 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 
267 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  42.19 
 
 
244 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 
275 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  39.63 
 
 
267 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  37.27 
 
 
267 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  39.78 
 
 
269 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 
246 aa  177  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 
267 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 
267 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  38.81 
 
 
270 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  38.75 
 
 
269 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  38.75 
 
 
266 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  39.26 
 
 
266 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
267 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 
265 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
267 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 
267 aa  175  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 
267 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  40.77 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  40.52 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  39.13 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.38 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  38.15 
 
 
271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 
265 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  40.93 
 
 
263 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  36.94 
 
 
266 aa  171  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 
265 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
267 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  39.63 
 
 
267 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  37.73 
 
 
267 aa  171  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 
271 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  37.68 
 
 
268 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 
265 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
268 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
270 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 
270 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  38.01 
 
 
278 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 
271 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  36.63 
 
 
267 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  41.22 
 
 
256 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  38.72 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  38.97 
 
 
266 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  38.72 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 
264 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 
270 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 
270 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 
254 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
270 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 
274 aa  168  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  39.26 
 
 
270 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  39.26 
 
 
270 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  39.26 
 
 
270 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  39.26 
 
 
270 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
270 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  38.6 
 
 
271 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  36.57 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  37.41 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  39.42 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  41.85 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  37.27 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  37.15 
 
 
252 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  36.68 
 
 
252 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  37 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  38.01 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  39.34 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  39.34 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  37.27 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  38.38 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  38.24 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>