More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0525 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  66.8 
 
 		 252 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  58.96 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  54.76 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  54.76 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  50.4 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  49.6 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  46.37 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  46.37 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  46.37 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  39.39 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  40.38 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  47.18 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  45.37 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  34.62 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  38.98 
 
 		 246 aa  178  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  38.85 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1005  dihydrodipicolinate reductase  45.37 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  41.96 
 
 		 254 aa  175  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 		 267 aa  174  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  36.02 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  39.05 
 
 		 289 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 267 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  40.39 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  39.61 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  34.59 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  38.6 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  39.68 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  34.21 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  36.4 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  34.93 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  38.69 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  37.08 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  34.56 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 265 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  34.08 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  37.8 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  39.53 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  39.22 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  34.59 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  35.21 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  39.22 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  34.21 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  41.6 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  34.46 
 
 		 267 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  35.21 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  35.9 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2439  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0628599  normal  0.395118 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  37.17 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  33.96 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  34.39 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  34.34 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  37.41 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  40.49 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  38.34 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  35.69 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  32.47 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  34.33 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  34.46 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  36.19 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  41.67 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  40.31 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  39.52 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  33.96 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0204  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>