More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0963 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  66.8 
 
 		 254 aa  343  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  61.04 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  56 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  56 
 
 		 251 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  49.6 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  48.81 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  45.75 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  48.04 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  39.44 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1005  dihydrodipicolinate reductase  46.19 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  50.25 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  39.39 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  45.97 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  45.97 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  36.67 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  37.84 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  35.79 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  43.06 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  43.06 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  39.61 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  35.29 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  37.85 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  39.04 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  34.83 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  38.2 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  35.56 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  35.58 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  34.56 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  35.42 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  35.42 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  33.96 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  35.19 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  35.79 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  38.34 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  37.65 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  35.16 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  34.34 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  34.35 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  34.83 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  34.46 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  37.94 
 
 		 242 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  36.68 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  34.35 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  34.6 
 
 		 284 aa  164  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 268 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  34.6 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  33.96 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  34.9 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  37.59 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  34.34 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>