More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1457 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  71.83 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  65.61 
 
 		 254 aa  349  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  66.27 
 
 		 254 aa  342  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  63.49 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  64.68 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  55.12 
 
 		 257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  52.65 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  46.56 
 
 		 263 aa  221  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  43.01 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  43.8 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 267 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  41.85 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  43.59 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 267 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  41.43 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  45.72 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  41.76 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  40.66 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  43.33 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  42.16 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  44.53 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 		 268 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  42.96 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  46.64 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  42.34 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  42.49 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  42.49 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  38.19 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  41.64 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  42.46 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  42.49 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  41.24 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  42.22 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  42.37 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  40.38 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  42.54 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  42.22 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  44.62 
 
 		 256 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  42.74 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>