More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1005 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1005  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  53.56 
 
 		 241 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  46.19 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  48.53 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  42.08 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  46.08 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  41.06 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  41.06 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  42.04 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  45.37 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  39.75 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  39.71 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  36.51 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  44.33 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  38.53 
 
 		 269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  37.8 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  38.25 
 
 		 267 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 		 263 aa  144  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  34.18 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  39.71 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.36 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  35.36 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  35.36 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  38.71 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  36.68 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  38.5 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  38.05 
 
 		 267 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  39.49 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  38.05 
 
 		 267 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  42.23 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  35.83 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  37.8 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  35.04 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  35.48 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  36.97 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  40.4 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  38.34 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  39.51 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  38.38 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  35.23 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  38.78 
 
 		 267 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  34.94 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  34.87 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  33.88 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  32.95 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  37.75 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  38.05 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  33.59 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  33.84 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  38.05 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  34.6 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  33.9 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  38.05 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  38.05 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  37.84 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  36.87 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  36.27 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  37.56 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  35.95 
 
 		 268 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 270 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  32.65 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  37.27 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  36.19 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  38.54 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  34.32 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0204  dihydrodipicolinate reductase  35.86 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  38.27 
 
 		 275 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>