More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0980 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
252 aa  495  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  61.51 
 
 
263 aa  284  7e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  62.15 
 
 
255 aa  279  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  55.38 
 
 
252 aa  268  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2743  dihydrodipicolinate reductase  53.26 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.939063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  42.52 
 
 
254 aa  194  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  44.62 
 
 
251 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  39.68 
 
 
255 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  42.46 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  41.34 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 
263 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 
276 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 
278 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  42.41 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  38.87 
 
 
267 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  36.96 
 
 
251 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  34.51 
 
 
251 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  37.02 
 
 
263 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 
252 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  41.44 
 
 
256 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  38.04 
 
 
257 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  42.41 
 
 
267 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  39.31 
 
 
274 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  38.28 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 
271 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 
255 aa  162  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 
267 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  32.81 
 
 
252 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
275 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  38.78 
 
 
271 aa  158  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  39.31 
 
 
267 aa  158  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
269 aa  158  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 
267 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
264 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 
267 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 
274 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  36.68 
 
 
261 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 
265 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 
267 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 
271 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
260 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  36.7 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  38.67 
 
 
241 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 
267 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  36.98 
 
 
267 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  36.88 
 
 
300 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 
267 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  36.98 
 
 
288 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  32.16 
 
 
254 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 
265 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 
271 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 
256 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 
246 aa  153  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 
267 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  38.81 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  38.81 
 
 
268 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  34.83 
 
 
271 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
267 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 
273 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 
273 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 
269 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  34.46 
 
 
270 aa  150  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 
268 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 
268 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 
269 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 
267 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 
266 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  34.81 
 
 
273 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 
267 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  38.02 
 
 
268 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  39.33 
 
 
265 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  32.4 
 
 
217 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 
270 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  39.38 
 
 
241 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 
270 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 
270 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 
270 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  36.93 
 
 
240 aa  148  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  36.4 
 
 
269 aa  148  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 
270 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  36.94 
 
 
267 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
268 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  46.11 
 
 
238 aa  148  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 
268 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  37.08 
 
 
267 aa  148  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 
270 aa  148  9e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0370  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  38.31 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  35.23 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  35.23 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  35.23 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  35.23 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>