More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1876 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  52.36 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1223  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0073  dihydrodipicolinate reductase  49.53 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  36.89 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  36.48 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  36.89 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  34.32 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  36.18 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  32.4 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  35.12 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  32.2 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  34.45 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  34.86 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  32.13 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  30.28 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  30.04 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00090  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  35.51 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  38.86 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  32.54 
 
 		 258 aa  136  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  36.08 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  32.54 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 269 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  29.39 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  30.04 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  32.94 
 
 		 261 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  34.36 
 
 		 266 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  30.42 
 
 		 275 aa  134  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  29.77 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  29.39 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  32.07 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  30.3 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  34.36 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  35.64 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  29.66 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  29.08 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  37.63 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  36.32 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  28.63 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  36.65 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  37.57 
 
 		 262 aa  131  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  33.97 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 		 271 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  28.52 
 
 		 268 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  30.12 
 
 		 269 aa  131  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  28.14 
 
 		 270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  31.94 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  28.52 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  29.43 
 
 		 267 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  36.32 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  32.31 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  28.24 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  35.51 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  28.9 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  28.9 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  35.6 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 268 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  27.76 
 
 		 265 aa  128  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  34.02 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  38.92 
 
 		 291 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  31.1 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  31.28 
 
 		 273 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  28.9 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  28.52 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  32.33 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  30.25 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  28.52 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  30.14 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  31.07 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  29.28 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  30.88 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  28.84 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  26.62 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  30.47 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  28.03 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  26.89 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  32.31 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  35.6 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  31.87 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  27.38 
 
 		 270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  27.38 
 
 		 270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  27.38 
 
 		 270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  32.65 
 
 		 269 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  27.49 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>