More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1170 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 291 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  64.53 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  34.59 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  35.77 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  31.87 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  31.75 
 
 		 267 aa  145  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  35.42 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  32.6 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 270 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  32.21 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  32.23 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  32.47 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  32.36 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  34.91 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  32.36 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  32.23 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  33.94 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  32.59 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  31 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  32.97 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  32.95 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  31.62 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  32.23 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  31.52 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  31.37 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  31.62 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  31.9 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  33.59 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  32.97 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  32.61 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  31.66 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  31.75 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  32.57 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  37.33 
 
 		 233 aa  133  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  31.68 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  31.37 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  31.37 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  31.37 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  32.48 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3789  dihydrodipicolinate reductase  31.48 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  30.63 
 
 		 268 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  30.63 
 
 		 268 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  30.63 
 
 		 268 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  30.63 
 
 		 268 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  30.63 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  30.6 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  32.06 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  30.63 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  30.63 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  35.06 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  31.5 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  32.06 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  34.94 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  32.48 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  30.88 
 
 		 270 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  30.77 
 
 		 267 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  31.14 
 
 		 270 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  32.48 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  32.06 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  32.48 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  32.48 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  32.48 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  32.48 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  38.92 
 
 		 217 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  31.87 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  32.12 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  32.12 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1729  dihydrodipicolinate reductase  31 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  30.88 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  30.88 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>