More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0170 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  97.04 
 
 
270 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  89.63 
 
 
270 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  84.07 
 
 
270 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  72.43 
 
 
273 aa  394  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  52.79 
 
 
263 aa  262  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  48.69 
 
 
263 aa  245  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  46.15 
 
 
267 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  45.79 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  45.42 
 
 
266 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  45.79 
 
 
267 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  46.15 
 
 
266 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  46.52 
 
 
266 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  44.12 
 
 
267 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  45.05 
 
 
268 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 
267 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  43.75 
 
 
267 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  46.47 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
267 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 
257 aa  216  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 
267 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  43.59 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  42.22 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  43.59 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  43.38 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  44.85 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.76 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  44.98 
 
 
255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  45.35 
 
 
254 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 
284 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 
254 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
267 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
267 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  43.01 
 
 
265 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
268 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
269 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 
252 aa  208  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
270 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
271 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
270 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  44.69 
 
 
270 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  45.05 
 
 
270 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  45.05 
 
 
270 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
271 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  41.7 
 
 
266 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  41.97 
 
 
268 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  41.97 
 
 
268 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
270 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
270 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 
265 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 
265 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  40.66 
 
 
267 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 
270 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
265 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
265 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  43.17 
 
 
273 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  43.17 
 
 
273 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  43.01 
 
 
267 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 
265 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  41.7 
 
 
269 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  43.22 
 
 
265 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 
276 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
271 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
265 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
270 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  42.44 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 
254 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 
268 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  40.81 
 
 
274 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  41.03 
 
 
269 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.34 
 
 
268 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  44.28 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
268 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
268 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
265 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  44.28 
 
 
263 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  42.34 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  40.96 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  42.12 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  42.44 
 
 
266 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  40.66 
 
 
267 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 
265 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  40.59 
 
 
271 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 
269 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 
268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  43.54 
 
 
263 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4608  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 
270 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.745671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>